莫尔道嘎镇地处额尔古纳市中部，西南距拉布大林镇136公里，北与奇乾乡接界，东部和南部与根河市毗邻，西与室韦乡相连。东西最大长度175公里，南北最宽处127公里，辖区总面积4160平方公里。该镇地处大兴安岭北段原始森林腹地，地表为起伏的山地，南北狭窄，东高西低，最高海拔1404米，最低海拔640米。属寒温带大陆性气候，年平均气温-5~-7℃，夏季多雷暴天气，易发生雷击火。